O antigo guerreiro das sombras japonês, gerou por muito tempo, medo e terror, pois atacaram o lado mais vulnerável do ser humano, a emoção.
Contudo, mesmo utilizando o ilusionismo operacional em missões, os ninjas eram totalmente voltados para o esquema de totalidade universal, para a unificação do homem junto ao senhor do universo criador de tudo e todos, justamente pelo fato de terem sido descendentes diretos dos antigos monges budistas e xintoístas.
Os conceitos religiosos e esotéricos do ninjutsu tiveram suas origens da doutrina religiosa denominada Mikyô, baseada numa filosofia de vida voltada para a simplicidade e contato pleno com a natureza, que por sua vez, descendentes da religião tântrica tibetana, uma das mais antigas filosofias religiosas do mundo antigo; em uma metáfora de entendimento, torna-se difícil a compreensão para o ocidental, do modo de vida do antigo guerreiro ninja, pois além de tais influências, tiveram primordialmente, tiveram forte influência religiosa quando os monges budistas chineses emigraram para o Japão, trazendo trazendo seus conhecimentos esotéricos e espirituais, originando através da evolução de pensamentos, idéias e novas culturas, as seitas Shingon e Shugendo; tal inovação religiosa se deu no século VI, onde se estruturou definitivamente após tanta influência vinda de toda a Ásia, a base religiosa e esotérica do antigo guerreiro ninja.

Hoje, o ninjutsu é uma arte marcial reconhecida pelo Império Japonês como uma pratica desportiva que visa manter o bem estar geral do corpo, da mente e das emoções; e principalmente através da pratica diária, alcançar o auto conhecimento técnico e filosófico.
Sendo adotado pelas maiores forças militares do mundo por intermédio de seus oficiais; porém, as tradições do ninjutsu se mantém intactas até hoje, mantendo uma essência pura e tradicional, onde muitos ocidentais encontraram harmonia, terapia e uma maravilhosa arte marcial adaptada para os dias de hoje e para todo o tipo de pessoa, sendo uma extensão cultural dos costumes, tradição e filosofia Zen Japonesa, contribuindo em muito para o crescimento e aprofundamento do eu junto ao universo, conhecendo a si mesmo e tornando-se um ser praticamente feliz, adaptando-se melhor ao meio ambiente e a todos que estão a nossa volta.