A los pocos dias de su arribo al pais, luego de estar secuestrado ilegalmente en Londres, el Senador Pinochet debio enfrentar un proceso judicial en su contra por el cual el Ministro instructor de la causa, Juan Guzman Tapia, solicito a la Corte de Apelaciones de Santiago el desafuero del ex Presidente de la Republica.

Este Ministro lo acusa de ser complice o encubridor del secuestro de 19 personas, delito que se habria realizado en 1973. Como este delito no esta cubierto por la Ley de Amnistia del a?o 1978 y el Ministro Guzman Tapia estima que estas personas seguirian secuestradas o a lo menos estaban todavia en esa situacion despues de la dictacion de la Ley de Amnistia, procedio a iniciar este proceso de desafuero. En este caso no se le dio ninguna importancia a que existieran certificados de defuncion que constataban lo contrario a lo que sostiene el Ministro Guzman y a las multiples declaraciones tanto de los presuntos implicados como de los abogados izquierdistas contrarios al senador Pinochet que han denominado este caso como el de la "Caravana de la Muerte" y no como el de la "Caravana de los Secuestros".

La directiva del Partido Socialista habia presentado el dia 5 de Julio de 1999 una querella en contra del senador Pinochet. El dia 16 de marzo de este a?o presento una segunda querella y fue el propio presidente de esa colectividad, senador Ricardo Nu?ez, el que acudio a la Corte para cumplir con el tramite correspondiente.

A continuacion, el diputado del Partido Socialista, Jaime Naranjo, amenazo a los Ministros de la Corte de Apelaciones expresando: "Considero que los Ministros de la Corte de Apelaciones de Santiago, de aducir finalmente razones de salud en su fallo a fin de evitar desaforar a Pinochet, no solo estarian interfiriendo en la accion de la justicia, sino ademas faltando gravemente a su deber de ejecutar y hacer cumplir las leyes, hecho que, como sabemos, constituye causal suficiente para proceder a una acusacion constitucional en su contra por notable abandono de sus deberes"
El ex Presidente Patricio Aylwin fue muy constante y activo en presionar a la Corte de Apelaciones. En extensa entrevista del Diario La Tercera el dia 21 de mayo de este a?o sostuvo: "Si yo fuera juez, no tendria la menor duda en acoger el desafuero". Expresiones similares las repitio pocas horas antes que se pronunciara la Corte Suprema.

El Consejo de Defensa del Estado, con la activa participacion de su Presidenta, Clara Szczaranski, se transformo en los hechos en un querellante mas .

La Comision por la Recuperacion de la Verdad Historica en declaracion publica sostuvo: "El Consejo de Defensa del Estado es un organo del Estado de Chile, cuyo fin preciso es defender el interes del Estado nacional. Sin embargo, despues de haber guardado un largo silencio frente a la gravisima violacion de la soberania nacional realizada por Espa?a y por Inglaterra al procesar y detener al senador y ex Presidente Pinochet, sin que se le haya conocido accion alguna destinada a defender la soberania de Chile, ahora interviene activamente tanto para intentar desaforarlo, como, ademas, para impugnar la validez de los examenes medicos que revelan que no puede haber un debido proceso en las actuales condiciones de deterioro de su salud".
Veintidos Senadores en declaracion publica fustigaron la actitud del Consejo de Defensa del Estado y le manifestaron que "la actitud que ha asumido y sus actuaciones judiciales resultan contradictorias con la posicion oficial del Estado de Chile ".