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Journal Browser | Citation Matcher

Clinical queries

Si tratta di una sezione di ricerca destinata a coloro che hanno interessi clinici. Ha incorporati dei filtri di ricerca studiati da Brian Haynes della McMaster University. Lo scopo di Haynes e colleghi era quello di studiare delle strategie di ricerca che permettessero di trovare studi clinici metodologicamente robusti su un certo argomento. Questa sezione non va usata da chi vuole trovare tutto quello che è stato scritto su una certa materia in quanto i filtri sono studiati appositamente per limitare i risultati agli studi più importanti.

Sono state studiate 4 categorie:

bulletTherapy (selezione di default)
bulletDiagnosis
bulletEtiology
bulletPrognosis

Si possono poi scegliere due livelli all'interno di ciascuna categoria:

bulletSensitivity: aumenta la sensibilità includendo articoli rilevanti ma probabilmente anche qualcuno meno importante (si ottengono più risultati)
bulletSpecificity (selezione di default): aumenta la specificità includendo solo gli articoli più attinenti (si ottengono meno risultati).

Questa sezione funziona aggiungendo alle nostre parole chiave dei filtri. Per esempio, utilizzando la query vitamin C AND common cold già vista all'inizio questa verrà così modificata da PubMed:

bulletSelezionando Therapy e Specificity (le opzioni di default) la query diventerà:

(((("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin C[Text Word]) AND ("common cold"[MeSH Terms] OR common cold[Text Word])) AND ((double[WORD] AND (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((blind[WORD] OR blindability[WORD]) OR blindbuffer[WORD]) OR blinde[WORD]) OR blinded[WORD]) OR blindedly[WORD]) OR blindedness[WORD]) OR blindended[WORD]) OR blindending[WORD]) OR blindengeld[WORD]) OR blindeninstituts[WORD]) OR blindenmission[WORD]) OR blinder[WORD]) OR blinderman[WORD]) OR blindern[WORD]) OR blinders[WORD]) OR blindess[WORD]) OR blindest[WORD]) OR blindfish[WORD]) OR blindfold[WORD]) OR blindfolded[WORD]) OR blindfolding[WORD]) OR blindfolds[WORD]) OR blindgrass[WORD]) OR blindh31[WORD]) OR blindiness[WORD]) OR blinding[WORD]) OR blindingly[WORD]) OR blindism[WORD]) OR blindisms[WORD]) OR blindlike[WORD]) OR blindloop[WORD]) OR blindly[WORD]) OR blindman[WORD]) OR blindness[WORD]) OR blindnesses[WORD]) OR blinds[WORD]) OR blindsac[WORD]) OR blindsack[WORD]) OR blindsacke[WORD]) OR blindside[WORD]) OR blindsight[WORD]) OR blindsighted[WORD]) OR blindsnakes[WORD]) OR blindspot[WORD]) OR blindspots[WORD]) OR blindstudy[WORD]) OR blindwell[WORD]) OR blindworm[WORD]) OR blindy[WORD])) OR placebo[WORD])) AND notpubref[sb])

e verranno trovati 30 riferimenti (aprile 2000).

bulletSe si seleziona Sensitivity, allargando così il campo di ricerca, la query diventerà:

(((("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin C[Text Word]) AND ("common cold"[MeSH Terms] OR common cold[Text Word])) AND (((randomized controlled trial[PTYP] OR "drug therapy"[Subheading]) OR "therapeutic use"[Subheading:noexp]) OR ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((random[WORD] OR randomaly[WORD]) OR randoman[WORD]) OR randomand[WORD]) OR randombred[WORD]) OR randombreds[WORD]) OR randomdigit[WORD]) OR randomdot[WORD]) OR randome[WORD]) OR randomed[WORD]) OR randomely[WORD]) OR randomer[WORD]) OR randomezed[WORD]) OR randomic[WORD]) OR randomicity[WORD]) OR randomil[WORD]) OR randomily[WORD]) OR randomingly[WORD]) OR randomisation[WORD]) OR randomisations[WORD]) OR randomise[WORD]) OR randomised[WORD]) OR randomisely[WORD]) OR randomises[WORD]) OR randomising[WORD]) OR randomisly[WORD]) OR randomiz[WORD]) OR randomizable[WORD]) OR randomizadely[WORD]) OR randomizado[WORD]) OR randomization[WORD]) OR randomizations[WORD]) OR randomize[WORD]) OR randomized[WORD]) OR randomizedly[WORD]) OR randomizely[WORD]) OR randomizer[WORD]) OR randomizes[WORD]) OR randomizing[WORD]) OR randomlike[WORD]) OR randomly[WORD]) OR randomlyselected[WORD]) OR randommess[WORD]) OR randommized[WORD]) OR randommobility[WORD]) OR randomnes[WORD]) OR randomness[WORD]) OR randomomized[WORD]) OR randoms[WORD]) OR randomsource[WORD]) OR randomyl[WORD]) OR randomyly[WORD]) OR randomzied[WORD]))) AND notpubref[sb])

e verranno trovati 165 riferimenti (aprile 2000).

In Tabella 1 e Tabella 2 sono elencate le strategie di ricerca sviluppate da Haynes e altre che possono risultare utili in ricerche particolari. Per utilizzarle possono essere trascritte su un editor di testi e associate alle parole chiave che descrivono gli argomenti che ci interessano; il tutto può poi essere trasferito, con il cut and paste, nella apposita casella di PubMed (la più appropriata è quella dedicata alla boolean search, se non altro per motivi di spazio).

Tabella 1 - Strategie di ricerca clinica (Haynes RB et al.) -
[Da GIMBE http://www.gimbe.org/Praticare-EBM/Quick-access.htm]

Primary research

Haynes RB, et al. J Am Med Inform Assoc 1994;1:447-58

Etiology

Max sensitivity

"cohort studies" [MESH] OR "risk" [MESH] OR ("odds" [tw] AND "ratio*" [tw]) OR ("relative" [tw] AND "risk" [tw]) OR ("case" [tw] AND "control*" [tw])

Max specificity

"case-control studies" [mh:noexp] OR "cohort studies" [mh:noexp]

Diagnosis

Max sensitivity

"sensitivity and specificity" [MESH] OR "sensitivity" [tw] OR ("diagnosis" [sh] OR "diagnostic use" [sh] OR "specificity" [tw])

Max specificity

"sensitivity and specificity" [MESH] OR ("predictive" [tw] AND "value*" [tw])

Prognosis

Max sensitivity

"incidence" [MESH] OR "mortality" [MESH] OR "follow-up studies" [MESH] OR "mortality" [sh] OR prognos* [tw] OR predict* [tw] OR course [tw]

Max specificity

"prognosis" [mh:noexp] OR "survival analysis" [mh:noexp]

Therapy

Max sensitivity

"randomized controlled trial" [pt] OR "drug therapy" [sh] OR "therapeutic use" [sh:noexp] OR "random*" [tw]

Max specificity

(double [tw] AND blind* [tw]) OR placebo [tw])

Tabella 2 - Strategie di ricerca (sistematic reviews, linee guida e clinical audit) -
[Da GIMBE http://www.gimbe.org/Praticare-EBM/Quick-access.htm]

Systematic Reviews

Hunt D, et al. Ann Intern Med 1997;126:532-538.

"meta-analysis" [pt] OR "meta-anal*" [tw] OR "metaanal*" [tw] OR ("quantitativ* review*" [tw] OR "quantitative* overview*" [tw] ) OR ("systematic* review*" [tw] OR "systematic* overview*" [tw]) OR ("methodologic* review*" [tw] OR "methodologic* overview*" [tw]) OR ("review" [pt] AND "medline" [tw])

Practice Guidelines

(GIMBEâ , unpublished)

"guideline" [pt] OR "practice guideline" [pt] OR "health planning guideline" [MESH] OR "consensus development conference" [pt] OR "consensus development conference, nih" [pt] OR "consensus development conferences" [MESH] OR "consensus development conferences, nih" [MESH] OR "guidelines" [MESH] OR "practice guidelines" [MESH] OR "consensus statement" [tw]

Clinical audit

(GIMBEâ , unpublished)

"medical audit" [MESH] OR "nursing audit" [MESH] OR "utilization review" [MESH] OR "drug utilization review" [MESH] OR "drug utilization" [MESH]

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Journal browser

E' una sezione che permette di trovare informazioni sulle riviste indicizzate in MEDLINE. Di una data rivista è possibile cercare per:

bulletTitolo
bulletNumero ISSN
bulletAbbreviazione standard MEDLINE

Il formato delle riviste che vengono trovate è il seguente:

Title ISSN Medline abbr.
NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE 0028-4793 N Engl J Med

Cliccando sul numero ISSN si viene reindirizzati al sito di PubList che fornisce informazioni sulla rivista in questione, mentre se si clicca sull'abbreviazione della rivista si effettua una ricerca degli articoli comparsi sulla stessa.

All'indirizzo http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/journals/loftext_noprov.html si può trovare un elenco aggiornato delle riviste disponibili sul Web che hanno links su PubMed. Alcune di queste riviste richiedono una registrazione gratuita o a pagamento per vedere gli articoli integrali.

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Citation matcher

Il National Center for Biotechnology Information ha sviluppato Citation Matcher come strumento per permettere agli editori di trovare il codice identificativo di PubMed o il MEDLINE Unique Identifier di una citazione senza dover usare la ricerca su PubMed. In questo modo gli editori potevano costruire sui loro siti dei links agli articoli su PubMed utilizzando il codice numerico trovato in questo modo. In seguito Citation Matcher è stato reso disponibile su PubMed.

L’interfaccia di Citation Matcher é molto semplice da utilizzare. Non é necessario introdurre i dati in ogni campo: Citation Matcher combinerá i dati che gli forniremo utilizzando la sintassi di PubMed e restituirà i risultati corrispondenti. Più campi completerete, maggiore sarà la probabilità di trovare il singolo articolo che state cercando (soprattutto se inserite il numero della prima pagina); nel caso PubMed non trovi nulla, provate a cancellare un dato alla volta in quanto potrebbe esserci qualche voce errata.

E' possibile cercare una citazione di cui si hanno gli estremi, utilizzando le informazioni bibliografiche a nostra disposizione (anche incomplete). Permette di cercare per:

bulletRivista
bulletVolume
bulletNumero
bulletNumero di pagina
bulletAnno di pubblicazione

Citation matcher può essere utilizzato anche per ottenere l'indice di un particolare numero di una rivista (tenendo presente però che non tutti gli articoli di una rivista finiscono necessariamente in MEDLINE: gli articoli che non rientrano negli argomenti di MEDLINE vengono esclusi).

Tramite il Batch Citation Matcher è possibile inserire numerose citazioni in sequenza per trovare i relativi articoli. Il formato dei dati inseriti deve essere:

Titolo|Anno|Volume|Numero prima pagina|Autore|Parola Chiave|

E' anche possibile interrogare il Batch Citation Matcher via e-mail. E' necessario inviare all'indirizzo citation_matcher@ncbi.nlm.nih.gov un messaggio con il seguente formato:

TYPE {Tipo di output} 
CITATIONS 
{prima citazione} 
{seconda citazione} 
{etc.}

in cui il Tipo di output può essere medline oppure pubmed: citation matcher invierà i risultati con l'identificatore unico rispettivamente di medline (UI) o di Pubmed (PMID).

Il formato delle citazioni dovrà essere:

Titolo|Anno|Volume|Numero prima pagina|Autore|Parola Chiave|

La parola chiave è un qualsiasi termine con il quale il ricercatore voglia marcare la citazione.

Esempi:

SCIENCE|1987|235|182|PALMENBERG AC||
BMJ|2000|||SMITH R||
JAMA|2000|||SMITH||

Riceveremo i risultati tramite un'email che avrà il seguente formato:

SCIENCE|1987|235|182|PALMENBERG AC||87094193
BMJ|2000|||SMITH R||AMBIGUOUS (6 citations) 
JAMA|2000|||SMITH||AMBIGUOUS 20195071, 20127470, 20123271 

Per recuperare le citazioni è sufficiente inserire su Pubmed il numero di identificazione citato al fondo della riga.

Per avere ulteriori informazioni inviate all'indirizzo citation_matcher@ncbi.nlm.nih.gov un messaggio con il comando HELP nel corpo.